I 1968 lyktes en gruppe nordkoreanske soldater i å krysse grensa til Sør-Korea. Deres oppdrag var å ta av dage den sørkoreanske presidenten, Park Chung-hee. De nordkoreanske styrkene ble stoppet, og Sør-Korea ville ha hevn. Etterretningstjenesten rekrutterte 31 menn for å slå tilbake mot Nord-Korea ved å forsøke å ta livet av deres "store leder", Kim Il Sung.

SILMIDO baserer seg på disse faktiske hendelsene når filmen portretterer rekruttene og det umenneskelige treningsprogrammet mennene skal gjennom. I SILMIDO framstilles rekruttene som utskudd i det sørkoreanske samfunnet, blant dem finner vi for eksempel folk fra dødscellene, gjengledere og andre kriminelle. De blir satt i en to år lang treningsleir hvor de blir regelrett hjernevasket av den steinharde disiplinen. Avfallet i det sørkoreanske samfunnet blir forvandlet til drapsmaskiner, hvis eneste mål er å utføre oppgaven de har blitt satt til: Å drepe Nord-Koreas leder.