På 60- og 70-tallet reiste en jevn strøm av antropologer til Amazonas for å forske på Yanomami-indianerne, en stamme som bodde langt ut i jungelen mellom Venezuela og Brasil, uberørt av sivilisasjonen. 40 år senere har det oppstått uenighet, krangling og skandaler antropologene imellom hva gjelder metode, etikk og påståtte ugjerninger. SECRETS OF THE TRIBE handler ikke så mye om vestens innflytelse på indianerne, men om konfliktene mellom et visst antall antropologer som har bygget sine karrierer på Yanomami-forskningen. Filmen bruker antropologenes egen metode på dem selv for dermed å avsløre narsissisme og beskyldninger om dårlig metodikk, pedofili og til og med massemord – samtidig som indianerne får en sjanse til å uttale seg. Filmen etterlater en bitter smak og en skepsis mot den antropologiske stammen som blir fremstilt usminket og med buksene nede. SECRETS OF THE TRIBE er en tankevekkende og delvis sjokkerende dokumentar om irrasjonelle holdninger blant antatt rasjonelle akademikere.