Plastikkirurger har et frynsete rykte, avfeid som leger som heller enn å bruke sine evner på å redde kvestede trafikkofre lever godt på de rike og overfladiske. Virkeligheten er, som så ofte ellers, en anelse mer komplisert. Mesteparten av plastisk kirurgi er ikke kosmetisk, men rekonstruktiv kirurgi som bøter på brannskader, ansiktsbrudd, eller som tilfellet er i BEAUTIFUL FACES: medfødte misdannelser. I filmen følger vi en gruppe barn og deres foreldre, samt plastikkirurger ved et sykehus i Mexico by. Barna har ulike medfødte deformiteter; legene gir dem mer eller mindre nye ansikter.

BEAUTIFUL FACES stiller en rekke viktige spørsmål: Er det riktig å la seg styre av samfunnets skjønnhets- og normalitetsidealer, og operere ellers velfungerende og friske barn? Operasjonene er ikke ufarlige, og vi blir vitne til dramatiske komplikasjoner. På den annen side vil et mer normalt utseende kunne gjøre livet lettere for barna, og bør ikke dette være det avgjørende?